“但是，”成吉思汗一句话，让耶稣教徒的心悬了起来。“大汗的意思是”一个教徒问道。
“我不会放过与我为敌的人，如果你们认为不妥，那你们白来了。”成吉思汗说着拉下了脸。教徒们互相看了看，最后无奈地说：“就按大汗的意思办吧。”
教徒们得到成吉思汗的保证，很高兴。他们为撒麻耳干的百姓而高兴。他们庆幸，他们为撒麻耳干的市民们做了一件大好事，起码挽救了很多人的生命。
于是，出现了奇怪的现象。蒙古兵源源不断地骑马进城，但是，他们却没有滥杀无辜，没有毁坏城里的设施，成吉思汗说话真的算话。
撒马尔罕城里就这样进入了蒙古兵。蒙古兵占领了外城。由3万多守军投降了蒙古兵。但是，阿勒巴尔汗带着其余的守军退入内城。他想借助内城顽抗到底。
成吉思汗让投降的和主动献城5万多人留住城内，将其余的统统赶到野外的空地上。一看这个情况，人们心里都害怕起来。因为据传说，成吉思汗是个杀人不眨眼的杀人魔鬼。
可是成吉思汗并没有大开杀戒，而是下令从里边挑选出工匠、艺人等。最后挑选出3万人。另外挑选壮丁3万人分配到自己军中效力。
但是，成吉思汗这个人复仇的心火是挺汪的。特别是对于抗击过他的人，他是不会放过的。成吉思汗进城后，对于抗击过他的人严加追究，把那些人全都杀了。
到了夜晚，成吉思汗嘱咐那些围困内城的人，要严加防范，敌人有可能乘夜色做文章。多年的军事斗争经验告诉成吉思汗，敌人是很狡猾的，越到危险的时候，越要小心。
果然，在当夜，内城守将阿勒巴尔汗率千余人冲出内堡，想杀出一条血路，想逃之夭夭。
双方发生激烈的冲突，那些要逃走的花剌子模将士被成吉思汗的军队打了回去。这使成吉思汗怒火升起，那些人临死还要挣扎一下。
第二天，成吉思汗下令把内堡围得水泄不通，加紧攻城。于是，双方箭矢纷飞，互相攻击。同时，成吉思汗命令加紧攻城。经过一番奋力攻击，终于攻破内城。
但是阿勒巴尔汗是个坚强的花剌子模英雄，他死也不投降，竟带着1000多将士逃进了一个清真寺里。连成吉思汗也被阿勒巴尔汗的顽强精神惊奇了。
成吉思汗下令，焚烧清真寺。这就是说，要把这个清真寺荡平！于是，蒙古军用火油筒焚烧清真寺。可惜，花剌子模的英雄阿勒巴尔汗，可惜那些1000多花剌子模英雄，与清真寺同归于尽。而后，成吉思汗下令，夷平花剌子模勇士们梦断的清真寺。这个清真寺从此从地球上被抹去了痕迹。
从此，成吉思汗经过战火剧烈的荼毒，彻底占领了撒麻耳干。
这个号称东方伊斯遭受了巨大的破坏，原来10余万户的城市仅剩下3万余户居民。